醫生建議要是得了紅眼病後要積極治療，一般要求要及時、徹底、堅持。一經發現，立即治療，不要中斷，症狀完全消失後仍要繼續治療1周時間，以防復發。
治療可沖洗眼睛，在患眼分泌物較多時，宜用適當的沖洗劑如生理鹽水或2%硼酸水沖洗結膜囊，每日2至3次，並用消毒棉簽擦淨睑緣;也可對患眼點眼藥水或塗眼藥膏;而用濕毛巾包在眼睛上冷敷或是用冰塊冰敷都有一定效果。
如為細菌性感染，可根據檢查出的菌種選擇最有效的抗生素眼藥水滴眼，根據病情輕重，每2至3小時或每小時點眼藥1次。常用眼藥水有10%～20%磺胺醋酰鈉，0.3%氟哌酸，0.25%氯霉素眼藥水等。晚上睡前可塗抗生素眼膏，如環丙沙星、金霉素或四環素眼藥膏，每次點藥前需將分泌物擦洗干淨，以提高療效。
對混合病毒感染的結膜炎，除應用以上藥物治療外，還可用抗病毒眼藥水，如為腺病毒可用0.1%羟苄唑眼藥水、0.1%肽丁胺乳劑;如為小病毒可用0.1%疱疹淨、0.1%無環鳥苷眼藥水等，每日2至3次，必要時還可應用干擾素等。有條件時可進行細菌培養，並作藥敏試驗，以選用適當的抗生素。
當炎症控制後，為預防復發，仍需點眼藥水1周左右，或應用收斂劑，如0.25%硫酸鋅眼藥水，每日2至3次，以改善充血狀態，預防復發。
醫生同時建議患者其實口服和輸液都不需要，關鍵是局部用藥量要足夠，要頻繁點藥，最好是10分鐘一次。諾酮類的眼藥水加上抗病毒眼藥水是最佳組合，同時必須加大抗生素含量。專家還建議已經感染的市民最好不要去藥店自己買藥搞掂，一定要到醫院就診對症下藥。