眼睛斜視的原因很復雜，多數發生在七歲以前的兒童，因為他們大腦的發育還不完善，支配兩眼運動，使其協調一致的融合功能尚未鞏固，如果受到內、外因的影響，如斷奶、換牙、驚嚇、震動等，都可以使大腦的融合功能受到破壞造成斜視。
有的兒童生了一場大病，發了幾天高燒之後，眼睛斜了，這可能是高燒或細菌的緣故。
有的兒童從床上掉在地上摔了一下，眼睛就斜了，這可能是眼的某一條肌肉受到損傷，或腦子受到震動，指揮眼球轉動的神經失靈造成的。
腦子裡長瘤子或出血，發炎，把管眼球轉動的神經壓住了，發生傳導支配障礙，眼球轉動也會受到影響。
較重的遠視或近視眼，也會變成斜視。
例如，近視度比較大的人，在做費眼力的針線活兒或看書的時候，把針線活兒，書本放到眼前，幾乎要挨著鼻子尖，才能看清楚。這時兩只眼睛不能長時間向內靠近，就只好用一只眼看東西，長久不用的另一只眼睛，視力就慢慢減退，也一天天往外偏斜，這就變成外斜視。同樣道理，一只眼視力好，另一只眼鬧過毛病視力不好或受了外傷失明的時候，往往也會發生外斜視。
斜視的主要危害
斜視的主要危害是影響雙眼單視功能，正常人能把雙眼分別看到的兩個影像合二為一，但由於斜視造成的眼位偏斜，患者就會有復視，混淆等一系列反應出現，久而久之產生抵制，影響雙眼視的建立。雙眼視缺乏就會影響孩子長大後職業的選擇及心理健康。