研究表明，男性疾病中常見的前列腺炎和沙眼衣原體可能有很大關系，臨床某些前列腺炎尤其是慢性炎症、反復發作的或加重的無菌性前列腺炎，沙眼衣原體可能就是這類前列腺炎的主要誘因之一。這類前列腺炎病人除了會出現會陰不適、疼痛、尿頻、尿急等排尿異常外，更有可能久治不愈，導致性生活質量下降，甚至性功能障礙。
前列腺液是精液中非常重要的組成部分，一旦前列腺發炎，則炎症滲出物的增加會影響精液的質量，如精液液化不良，導致精子活力下降，從而影響受孕。
研究明確表明，女性感染沙眼衣原體後，沙眼衣原體可由宮頸上行到子宮和輸卵管，引起無症狀的上生殖道感染，導致異位妊娠、原發性不育。
長期沙眼衣原體炎症會導致輸卵管內膜細胞發生變性改變，久而久之，輸卵管也會與周圍髒器發生粘連，使輸卵管蠕動發生障礙。這種病變達到一定程度，可影響受精卵的運送，嚴重者導致輸卵管閉塞。
因此，一旦出現眼部不適，要積極就診。一旦患有沙眼不僅可能影響視力，甚至會造成不孕不育。