對於一些青光眼， 可選擇手術治療。抗青光眼手術主要作用是防止房角阻塞，加速房水的排洩和減少房水生成。
防止房角阻塞，即所謂的“內引流”手術。一種是周邊虹膜切除術，它適用於具有相對瞳孔阻滯的原發性閉角型青光眼早期(臨床前期、先兆期)，小梁引流功能正常(房角開放大於1/2)的發作後間隙期和慢性閉角型青光眼。另一種是節段虹膜切除術，適應症同周邊虹膜切除術，具有下列情況時選用：①角膜中央混濁，無法檢查眼底。②瞳孔移位。③長期使用縮瞳劑，瞳孔不能自然復原。④瞳孔領區有殘膜或機化膜阻擋。
另辟通道加速房水引流，即“外引流”或“濾過”手術。有小梁切除術、鞏膜切除術、鞏膜灼瘘術。現在常用小梁切除術，尤其是各種改良後的小梁切除術，適應症廣，術後並發症少，療效較好。這類手術可用於藥物治療無效的開角型青光眼，小梁過濾功能受損和房角關閉大於1/2的閉角型青光眼，大多數繼發性青光眼及晚期先天性青光眼。對那些閉角型青光眼急性發作後，瞳孔散大、充血、眼壓控制不良者，上述三種手術均難以見效，此時可選用虹膜嵌頓術。
減少房水生成有睫狀體分離術、睫狀體冷凍術。此類手術有較高的並發症，一般用在無晶體眼青光眼、絕對期青光眼、新生血管性青光眼和其他抗青光眼手術多次失敗後。
另外尚有幾種特別的抗青光眼手術：早期先天性青光眼可選擇房角切開術或小梁切開術；青光眼控制不良並有明顯白內障者采用小梁切除術聯合白內障摘除術；惡性青光眼藥物治療無效可選擇後鞏膜切開+前房注氣+平坦部玻璃體切割術，必要時作晶體摘除術；濾過性導管植入術用於一般手術不能成功的難治性青光眼、新生血管性青光眼、青年性和無晶體性青光眼，以及葡萄膜炎性和混合性青光眼。