沙眼衣原體是一種致病微生物，即不是細菌，也不是病毒。它可以引起尿道感染，是淋病菌以外，較為常見的性傳播疾病。這種尿道炎的典型表現是尿道刺癢、尿痛和排尿困難。在女性，還可同時有陰道炎、宮頸炎，甚至引起盆腔炎。
沙眼衣原體可用特殊檢查方法檢測。
女性感染此病還會導致不孕、宮外孕。孕婦患病，其新生兒經產道感染也可誘發眼結膜炎，或發生肺炎。沙眼衣原體感染可持續較長時間，需要及時而充分的治療，否則容易遷延及復發。
一般可選用紅霉素、四環素、磺胺類藥物。青霉素對於這種非淋菌性尿道炎無效，如若合並淋病感染，才用青霉素。病菌在治療後要重復多種化驗。
配偶的治療仍然是值得強調的。
