沙眼感染早期引起不同程度的怕光、流淚、發癢、異物感、分泌物增多等眼部不適感，眼睑結膜血管充血、乳頭增生、濾泡形成，嚴重者可侵犯角膜而發生角膜血管翳。角膜上有活動性血管翳時，刺激症狀變為顯著，視力減退。晚期睑結膜發生嚴重瘢痕，使睫毛向內倒長形成倒睫。睫毛持續地磨擦角膜引起角膜渾濁、白色瘢痕，晚期常因後遺症，如睑內翻、倒睫、角膜潰瘍及眼球干燥等，症狀更為明顯，並嚴重影響視力。
如何辨認沙眼
沙眼有5個主要體征。一個沙眼患者可以同時有一個以上的體征。WHO已經建立了辨認和命名這些體征的簡化分級系統。
1、沙眼性炎症—濾泡（TF）
這是沙眼第一體征，最常見於兒童，有眼紅、粘性物、眼癢、眼痛等不適，眼睑結膜面（把眼睑翻過來看）有稱為濾泡的小白點。
2、沙眼性劇烈—炎症（TI）
當上眼睑結膜面嚴重紅腫、炎症性增厚使血管模糊時，第二個體征沙眼性劇烈—炎症（TI）就可以被確認。
3、沙眼性疤痕（TS）
經過反復的感染可見第三個體征即眼睑的結膜面出現疤痕體征——眼睑結膜面看起來像白色條紋。
4、沙眼性倒睫（TT）
當疤痕引起眼睑內層增厚和眼睑形態改變時，它向下牽拉睫毛指向眼球，睫毛摩擦角膜，這稱為倒睫，即出現第四個體征沙眼性倒睫（TT）。
5、角膜混濁（CO）
如果倒睫持續摩擦角膜，看起來本應清亮的角膜發白，這就稱為第五體征——角膜混濁。
世界衛生組織（WHO）提出了有效的控制沙眼的四個要素，即手術，抗生素、诘面、改善環境。具體內容如下：
由於沙眼衣原體常附著在患者眼睛的分泌物中，任何與此分泌物接觸的情況均可造成沙眼傳播感染的機會。
1、養成良好衛生習慣，保持面部清潔，不用手揉眼。
2、手巾、手帕要勤洗、曬干，一人一巾專用，不能隨便使用他人手帕手巾。
3、用流水洗臉，如用臉盆，使用前後要做好消毒。
4、家庭作好滅蠅、滅蚊，清除滋生地。
5、注意水源清潔，以阻斷沙眼傳播的途徑。減少感染的傳播，防止沙眼的感染流行。
6、保持睡眠區的通風隔離。