沙眼衣原體患者可通過性接觸傳給性伴侶導致泌尿系感染。沙眼衣原體是一類在細胞內寄生的微生物，大小約250～450nm。四環素、紅霉素、氯霉素對它有抑制作用，而鏈霉素、新霉素對它則無效。常用的消毒劑如0.1%甲醛、0.5%石炭酸可將衣原體迅速滅活。沙眼衣原體是引起非淋菌性尿道炎的主要病原體，由前述可知，非淋菌性尿道炎的40%～50%是由沙眼衣原體感染引起的。
1可以在醫生的指導下選用敏感的抗生素治療，一般療程為2周，嚴重沙眼應全身應用抗生素,一般療程3～4周。口服四環素，如果忌用四環素，可選用強力霉素或紅霉素、螺旋霉素，並且不間斷的用藥。多運動，提高自己的免疫能力，不要坐的時候太長，、不能騎車。要多飲水、不能飲酒。
2沙眼衣原體會引起一系列的疾病，比如沙眼、膿性結膜炎、泌尿生殖道感染等，如果患者同時出現了尿頻、尿痛等尿路不適應症狀，多半考慮是泌尿生殖道疾病的感染。一般在抽血中檢查出沙眼衣原體IgG呈陽性，只能說明沙眼衣原體的抗體呈現陽性，而不能確診為沙眼衣原體感染。
3在治療方面要積極配合治療，使用正確的藥物，還能根據中醫的整體觀念，治療其相關的並發症，才能更好更快的恢復健康，盡量不要吃帶有刺激行的食物或者容易引起過敏的食物，，保持衛生，勤換洗衣物。細菌是不可能全部殺死的，只有提高自身的免疫功能。
平時注意衛生，勤換洗衣物，洗澡，避免再次感染細菌，加強鍛煉，提高自身的免疫能力，可以選用一些抗生素治療。比如紅霉素之類的，平時多喝水，少飲酒，不要吃帶有刺激的食物。