免疫赦免是指免疫系統對抗原的無視或耐受，是眼局部對免疫應答的保護性修飾，既提供免疫保護作用，又將炎症反應降低到最低程度。眼的獨特免疫應答的結構基礎分述如下：
眼各組織免疫學的特點
(一)淚液
當病原微生物進入結膜囊，可以被淚液稀釋沖洗除去，或被淚液中的溶菌酶、乳鐵蛋白、免疫球蛋白和補體等抑制及殺滅。溶菌酶占淚液蛋白的20%~40%，可與補體、抗體協同攻擊細菌並刺激機體產生抗感染免疫反應。
(二)結膜
正常結膜主動參與眼表面的免疫防御。結膜的血管和淋巴管可以加速免疫細胞的轉運。結膜還有各種免疫細胞，如上皮層的朗格漢斯細胞和實質層的淋巴細胞、漿細胞、肥大細胞和樹突狀細胞。結膜還有一種特殊的免疫結構一一結膜相關的淋巴樣組織，淋巴細胞在這些區域呈疏松形式的聚集，或形成具有生發中心的次級淋巴濾泡，含有T細胞、B細胞和分泌Ig的漿細胞，可以隨時與侵入的致病因子進行局部的特異與非特異性免疫反應。
(三)角膜
角膜具有獨特的解剖學和生理學特征，一方面可以發生免疫性疾病，另一方面又具有免疫赦免特性。根據部位不同，一般將角膜分為周邊角膜與中央角膜兩部分。周邊角膜與富有血管和淋巴管的結膜相銜接，從而為免疫應答的傳入弧提供了通道。來自結膜和表層鞏膜的血管向透明的角膜延伸0。5mmo這種結構使得某些免疫活性細胞和分子可遷移和擴散進入角膜。
在角膜中除存在體液免疫組分之外，還具有免疫系統的細胞成分。朗格漢斯細胞是角膜免疫防御系統的關鍵細胞，主要位於角膜周邊部。當角膜發生感染和移植排斥反應時，LC可從周邊向中央遷移。LC是最有效的專職性APC，在觸發局部的免疫應答過程也中起著重要的作用。
(四)鞏膜
鞏膜內含有Ig、經典途徑和旁路途徑的補體成分。這些成分主要來自周圍的血管。正常的人鞏膜沒有淋巴細胞、巨噬細胞、LC和中性粒細胞。針對炎症刺激，其炎症細胞來自鞏膜表層和脈絡膜的血管。由於鞏膜的膠原特性，許多系統性自身免疫性疾病，如膠原血管性疾病，常可累及鞏膜。
(五)晶狀體
由透明薄膜包圍晶體纖維，隱蔽包含有多種抗原成分，被認為是免疫源基地，一旦晶狀體囊破裂，皮質移入前房或玻璃體，就可作為抗原誘發特異性免疫反應。
(六)脈絡膜
脈絡膜具有下述免疫特征：①含有很豐富的血管及海綿樣血管床是免疫復合物易於沉積的部位，這種大血流量可以網羅許多血液來源的病原微生物；②由於淋巴細胞聚集並有較多肥大細胞和吞噬細胞被認為是眼球的免疫反應中心；③脈絡膜存在有大量的肥大細胞。由肥大細胞釋放的炎症介質可能有助於免疫活性細胞向眼內組織的擴展，特別是淋巴細胞的遷移；④脈絡膜的基質和玻璃膜具有類似腎小球基底膜和關節滑膜的膠原彈力纖維，因此，可以發生交叉免疫反應，出現多器官組織的免疫性疾病。
(七)視網膜
視網膜含有許多種類的致葡萄膜視網膜炎抗原。但是在正常生理狀態下並沒有觸發疾病，提示視網膜也處於一種免疫赦免狀態。目前認為其主要機制有：①組織隔離：在正常情況下視異性抗原；②視網膜內缺乏行之有效的APC：視網膜雖然具有巨噬細胞和小膠質細胞，但這些細胞具有下調而非上調局部免疫反應的作用；③基礎性表達FasL：該分子形成一種分子屏障，以誘導人侵的Fas+淋巴細胞和其他致炎性白細胞發生凋亡。