眼部化學燒傷的治療可分早期及晚期兩個階段。早期主要是急救和防止壞死病變進一步擴展，恢復傷區組織營養，防止感染，減少並發症和後遺症。晚期針對後遺症進行治療，如眼球粘連、瘢痕、肉樣血管翳、角膜白斑及眼干燥平等。
1.眼部化學燒傷的急救和早期治療：立即清除有毒物質，減輕組織反應。
⑴沖洗：應分秒必爭，清除化學物質以減少其與眼部組織的接觸，盡量減輕燒傷程度。一切化學燒傷均應就地用淨水清洗眼部，或將面部浸入水盆中，拉開雙眼不斷搖動頭部，充分部首眼部。經急救後再送醫院救治。
醫療單位應常備25mg高錳酸鉀粉，急用時入入500ml無菌生理鹽水內，配成1∶2萬濃度，立即沖洗10～15分鐘。因高錳酸鉀液釋放活性氧，興奮細胞內呼吸，具有解毒防腐作用。此種沖洗應在傷後幾分鐘內完成才有效。對角膜、結膜的壞死組織亦應用1∶2萬高錳酸鉀液沖洗掉，每日換藥時均應進行此種操作，直到壞死組織脫淨為止。對石灰燒傷者，並可加用1%～2.5%依地酸二鈉（EDTA-2Na）液沖洗，以排出滲入角膜的鈣質。以膠原溶解酶抑制劑如2.5%～5%半胱胺酸等，頻頻滴眼，對治療鹼燒傷的角膜潰瘍有效。
⑵結膜下注射自家全血及血清：具有稀釋毒物，分離組織，阻止燒傷向深部滲透的作用，並可改善角膜營養，促進組織再生，也能防止睑球粘連的形成。Berman等指出人血清中a2巨球蛋白可抑制角膜的膠原溶解酶。
⑶前房穿刺：一般認為應在傷後1至2小時內進行。Grant發現房水pH值上升至10，在15至45分鐘內可恢復正常。故時間過久則臨床價值不大。前房穿刺不僅排除有毒物質，新產生房水亦有消炎和營養作用，有助於受傷組織的修復。
⑷結膜切開術：結膜放射狀切開，結膜下略作分離和沖洗，以達放出結膜下鹼性液體及解毒、減張、改善角膜供血之目的。
⑸結膜下中和注射：酸燒傷時可注射5%磺胺嘧啶鈉溶液每次1～12ml。鹼燒傷時可注射5%維生素C2ml，大部分吸收後再注射一次，以後每日1～2次，連勝3～4天。維生素C不僅起中和作用，且與角膜的膠原合成有密切關系。但據有關實驗報道，抗壞血酸結膜下多次注射，對燒傷後的結膜刺激較重，可加重眼球粘連，故可同時采用靜脈注射，50%葡萄糖40ml加抗壞血酸1g或2g，每日一閃。對治療角膜、結膜的壞血病是有益的。
⑹抗炎預防感染：鹼燒傷後應注意抗炎及預防繼發感染。局部使用抗生素及阿托品散瞳，7天內口服皮質類固醇及非激素抗炎藥物（消炎痛等）對減輕角膜水腫及前房滲出有一定作用，但局部應忌用皮質類固醇，以免加重角膜潰瘍，甚至穿孔，亦可引起繼發細菌和毒菌感染。
⑺膠原溶解酶抑制劑的作用：目前有依地酸二鈉、半胱胺酸、青霉胺、甲孕酮等藥物能使膠原酶失去活性，以延緩或阻止角膜潰瘍的發生，高濃度的膠原酶抑制劑對角膜有一定毒性，可致角膜水腫混濁，並延遲上皮形成。膠原酶抑制劑應在傷後2周開始應用。
⑻肝素結膜下注射：每日一次，每次500～625u（0.4～0.5ml）可溶解角膜緣血栓，疏通和恢復循環有一定效果。但亦有持不同意見者。
⑼結膜或粘膜移植：大面積的重度化學燒傷，切除壞死的結膜及表層鞏膜，移植另眼的結膜或自體粘膜可防止角膜穿孔和睑球粘連，因新鮮組織的活組織是新生血管的良好基礎，移植的結膜或粘膜可起橋梁作用。加速受傷組織和血管的再生，增進營養。一般認為粘膜移植最好在傷後48～72小時進行。為了預防睑球粘連，結膜囊內塗布大量抗生素眼膏，塗時以玻璃棒分離上下穹窿部。
⑽角膜移植：即將穿孔的角膜潰瘍可行治療性板層角膜移植。
2.眼部化學燒傷的晚期治療：消除睑球粘連，為爭取復明創造條件。
⑴嚴重的鹼燒傷，廣泛破壞了結膜的環狀細胞及淚腺管口，使淚液減少或缺如，而產生眼干燥及睑球粘連。人工淚液僅能減輕症狀，腮腺管移植，因分泌液中含有澱粉酶對角膜基質的粘多糖有消化作用，從而影響以後的角膜移植林。采用親水軟接觸鏡，配合人工淚液點眼及淚小點封閉，亦能減輕眼干燥症狀。
⑵角膜移植：鹼燒傷後的角膜移植具有很大危險性，並發症多。傷口愈合不良、移植片感染、排斥反應後移植片自溶、遷延性葡萄膜炎及眼球萎縮等一系列嚴重的並發症都可能發生。但在燒傷早期，如角膜潰瘍有穿孔趨勢，可立即作治療性板層角膜移植。在燒傷後，變薄的角膜伴密集的新生血管或變厚伴有大量增生瘢痕及肉樣血管翳，穿透性角膜移植不能成功。須待1年以後炎症反應完全靜脈，對新生血管，用β射線照射，總量400～420γ；或氩激光擊射使之萎縮。照射半年後，先作改善基地的板層角膜移植術，使角膜厚度趨於正常。在此基礎上待1年以後方可考慮小直徑的穿透角膜移植。若傷眼為僅有的單眼，更應慎重從事，在具備上述條件時，盡量作板層全角膜移植術。應采用新鮮角膜材料，保留上皮，用極細縫線，術後正確使用皮質類固醇及膠原酶抑制劑點眼，以期獲較發效果。
人工角膜移植；國內外均處於研究試用階段，對角膜移植失敗的病例，或不適於角膜移植者，作人工角膜移植偶爾可獲驚人效果，但療效多不持久，因最終人工角膜片脫落導致手術失敗。此方法正在改進中。