眼藥有很多劑型，最常用的是水劑；還有一種混懸液劑型，如可的松滴眼液，用前須先搖勻再使用，以免影響藥效。眼藥宜存放在密閉、陰涼、避光的地方，因為溫度、光線、時間是影響藥效的三大因素，可加速藥物分解，使其失效。為保證藥物療效，最好將其放在冰箱裡冷藏保存。
點眼藥水前，患者應洗淨雙手，用消毒干棉簽拭去眼內的分泌物，以免沖淡藥物濃度。
滴藥時應頭後仰或平躺，用手將下眼睑下拉，眼向上看，將滴管接近眼，勿接觸眼球，滴入眼液2～3滴，一日3～4次，注意勿將藥液直接滴到黑眼珠上，以免刺激眼睛發生瞬目反應（眨眼）。
在滴眼藥水後立即用手指或棉球按壓鼻內眦處2～3分鐘，以免藥液經鼻淚管進入鼻腔被鼻黏膜吸收，引起不同程度的中毒症狀：輕者全身稍感不適、輕度口干、顏面潮紅；重者全身不適、煩躁不安。
若患者病情需要幾種眼藥同時使用，須間隔一定時間交叉滴眼，滴後閉上雙眼休息5分鐘左右。眼藥膏應在晚上睡前塗，以防止白天塗藥膏後視力模糊影響工作和生活，而且還可以保證夜間眼結膜的藥物濃度。
阿托品眼藥水主要用於治療屈光不正、散瞳驗光，還可治療虹膜睫狀體炎和深層角膜炎等，但青光眼患者禁用，老年患者也應慎用。