目前，手術是治療先天性白內障唯一有效的方法。中山大學附屬眼科醫院眼科學教授劉奕志指出，由於兒童眼球正處於發育階段，十分脆弱敏感，與成人不同，因此，對於白內障的手術也不盡相同。目前，小兒先天性白內障的手術治療要分兩個時期完成。
（1）第一期手術移除患兒的晶狀體
一般來說，手術年齡越晚，患兒的視力越差。那麼是不是越早手術越好？劉奕志說，肯定不是越早越好，過早進行手術，孩子對手術的炎症反應劇烈，很容易出現並發症，如繼發性青光眼等。何時為最佳的手術時機？目前，國際眼科界尚未達成統一的認識。不過，臨床經驗顯示，患兒3個月左右便可手術，最晚不要超過6個月。
（2）第二期手術植入晶狀體
移除患兒晶狀體，只是解決了問題的一大部分。這就要求植入人工晶體以替代原有的混濁晶體，以達到矯正視力、防止弱視、恢復融合功能及立體視覺的目的。這就是二期手術。
術後還需要治療弱視
中山大學附屬眼科醫院白內障科的主任陳偉蓉說：“除了以上兩期手術外，接下來就要治療患兒的弱視，因為先天性白內障患兒存在不同程度的弱視。不治療的話，白內障患兒即使手術也不能獲得良好的視力。”
由於弱視治療是一個長期的過程。短則1-2年，長則7-8年，有些家長操之過急，想在幾個月內就把弱視矯正過來，這種想法是不現實的。陳主任表示，家長應堅持定期帶孩子到醫院進行弱視功能訓練治療。佩戴准確合適的眼鏡、遮蓋療法、弱視治療儀訓練治療、藥物治療等。
最後要提醒的是，手術後，大約1-2年幾乎100%的患兒還會出現後發性白內障（即白內障囊外摘除術或晶狀體外傷後，晶狀體皮質未能完全吸收，所遺留的殘余部分繼發混濁），還需要進行激光治療。但是，在臨床工作中，個別家長沒有認識到這個隨訪重要性，未能做到堅持定期復診，任由疾病發展，直到出現一些症狀才回到醫院檢查。