臨床上，新生血管性青光眼分三個階段：青光眼前期、開角型青光眼期、比角型青光眼期。
青光眼前期眼壓正常，僅在虹膜及房角出現細小新生血管。此期最有效的治療措施是激光全視網膜光凝術，光凝破壞缺氧視網膜，增加視網膜血管灌注，中斷了新生血管產生的根源，全視網膜光凝後新生血管萎縮。屈光間質混濁者可用全視網膜冷凍術。
開角型青光眼階段眼壓升高，新生血管增加。如視力尚好，屈光間質清，藥物控制眼壓，避免用縮瞳劑，全視網膜光凝仍首選。藥物不能控制眼壓者，可選用手術，如鞏膜瓣下引流管植入及活瓣植入術、濾過手術、睫狀體冷凍術。
閉角型青光眼階段房角關閉，眼壓很高。可試用藥物控制眼壓，有條件時作全視網膜光凝和房角光凝，然後采用上述手術治療。晚期已無光感的病人，疼痛嚴重，可球後注射酒精和氯丙嗪減輕痛苦。角膜大泡、潰瘍者可選擇眼球摘除。