游泳池和自然水域都會受到病菌或化學物質的污染，其中最為常見也最易傳染上的疾之一病便是眼病。
沙眼
沙眼是一種由衣原體感染引起的慢性炎症性眼病，通常發生在結膜和角膜。沙眼衣原體可通過游泳池水傳染，使健康人罹患沙眼，沙眼有潛伏期，通常在1-2周後發病，出現眼紅、異物感、畏光、流淚、分泌物增多等症狀，結膜則表現充血、水腫、粗糙不平等。
急性結膜炎
急性結膜炎俗稱“紅眼病”，多由急性結膜炎桿菌、肺炎雙球菌感染引起，患者發病快，眼紅，有異物感、燒灼感，膿性分泌物多，早上起床時睜不開眼，可伴發熱、頭痛，但擦洗後並不影響視力，一般也不會疼痛，3周或1個月內可自行恢復，不會留後遺症。
流行性角膜炎
流行性角膜炎是一種由病毒經游泳池水傳染的眼疾，症狀類似結膜炎但較之嚴重，即紅腫消失後角膜上會出現多個小點狀炎症浸潤，患者疼痛、流淚、怕光的現象較明顯，由於角膜上往往會留下不同程度的點狀薄翳，長年不退會對視力有一定影響。
為防止傳染眼疾，游泳前應進行體檢，凡患沙眼、結膜炎者，未治愈前禁止游泳；在紅眼病流行的時候不應去游泳，不與有眼疾的人一起游泳，少觸摸水龍頭及門把手；游泳時戴上護眼罩對減少感染眼疾也有一定作用，每次游泳後應用清水洗頭、洗臉；游泳者在游泳後還可滴上少許氯霉素等眼藥水或滴眼劑。