真菌性鞏膜炎也是常見的一種鞏膜炎，在臨床上分為淺表和深部兩大類，且該病的發病率正在逐年遞增，因此也引起了社會和醫學界的極度關注。那麼，真菌性鞏膜炎是怎樣引起呢？
真菌性鞏膜炎的發病原因是由於引起鞏膜炎的真菌是真核微生物，在空氣、土壤和自然界中廣泛分布，可分為酵母菌、真菌和二態菌。最常見引起鞏膜炎的是絲狀菌，如曲霉菌、支頂孢菌；另一些形成鞏膜感染的是二態絲狀菌如申克孢子絲菌、鼻孢子菌等，大多數為腐物寄生菌，在全身或局部創傷以及免疫力低下時則發生機會性感染。危險因素有：意外創傷特別是植物性的和土壤因素的鞏膜和(或)角膜外傷、眼科手術如翼狀胬肉切除後用β射線照射、視網膜脫離的鞏膜扣帶術以及全眼球炎、全身細菌及病毒感染、免疫系統異常、慢性消耗性疾病、長期配戴角膜接觸鏡、靜脈吸毒者。
真菌性鞏膜炎中多數深部真菌病的病原菌是機會性真菌，只在機體免疫功能降低，特別是細胞免疫功能降低時，它們才侵襲組織而致病。淺表真菌感染，很少誘發免疫反應，凡受真菌侵入的個體，可能出現遲發性變態反應，一般在感染10～14個月即可表現，這在宿主獲得特異性抗真菌感染方面具有重要的意義，致敏T淋巴細胞能激活並增強巨噬細胞對真菌的吞噬和殺傷作用。特異性細胞免疫功能健全者，原發的真菌感染常被局限化，在局部形成肉芽腫；特異性細胞免疫功能低下者，則易發嚴重播散性感染，並進一步削弱機體抗感染能力，招致細菌混合感染。深部感染能刺激機體產生特異性抗體，這類機體能否預防真菌再感染，尚無肯定的證據，一般認為真菌感染誘發的抗體應當不是獲得抗真菌免疫的重要機制。
真菌性鞏膜炎的發病原因機制比較復雜，但總的來說，就是因為感染真菌而引起的，因此日常生活中要注意防治。