飛秒激光是人類目前在實驗室條件下所能獲得最短脈沖的技術手段。激光脈沖聚焦到角膜組織中，產生光爆破；每一個脈沖的光爆破，產生一個微離子；每一個微離子，蒸發大約1微米的角膜組織；蒸發角膜組織產生擴展的水泡和CO2氣泡，水泡和氣泡被角膜組織吸收，角膜組織因此被分離。
據了解，飛秒激光可以在不損傷角膜上皮和前彈力層的條件下准確切開角膜基質層，並且幾乎沒有熱傳遞和沖擊波，在整個過程中幾乎不會有周圍組織損傷，這一點是其他切開技術無法比擬的；用飛秒激光手術制瓣，與傳統的角膜板層刀制角膜瓣相比，制瓣切割精度更精確、安全性更高；並且手術可於角膜內的任意位置，按任意形狀來切角膜，瓣蒂可置於任一方向。
此外，飛秒激光的優勢還在於：角膜基質床平滑，減少了術後不規則散光；對角膜上皮損傷小，降低術後淚膜的不穩定性，相對減少干眼的發生率。
盡管飛秒激光前景可觀，但就整個激光手術而言，並非所有的人都能做這樣的手術。激光手術通常要求患者年齡在18—60歲之間，近視度數相對穩定2年以上。由於術後可能出現眩光的現象，所以司機等特殊職業者，需結合暗瞳等檢查慎重設計手術。
因為18歲以下者眼球未發育完全，屈光狀態尚未穩定，故手術效果也不穩定，若盲目接受手術視力極有可能回退。而嚴重干眼病、突眼症及眼睑關閉不全、急性眼部炎症、青光眼、獨眼患者等也是手術的禁忌症。此外，還要提醒廣大近視患者，要做激光治療手術，最重要的是做好術前篩查，將一切有可能引起的不良因素及不適合因素篩查出來。即使通過手術取得了良好的裸眼視力，也要定期檢查眼底及視力。
激光手術後，眼睛裡的碎屑要沖洗干淨，不沖洗干淨容易造成並發症，導致上皮植皮、圓錐角膜病，比如變性蛋白質不沖洗干淨就容易造成抗原抗體反應，導致圓錐角膜病。在一些不正規的醫院，有些器械消毒不淨或沖洗不干淨，也會在術後出現並發症。還有的患者做了手術後會出現雙眼單視功能下降、背壁敏感度下降等問題，因此手術選擇一定要慎重。