一般淺層鞏膜炎，只要治療及時，視力及預後都較好，不會發生什麼並發症。但深層鞏膜炎或反復發作，久治不愈的頑固病例，如治療不及時，或用藥不當，常會引起不同程度的並發症。嚴重的前鞏膜炎病變侵入角膜周圍組織時，可並發鞏膜角膜周圍炎、前葡萄膜炎、繼發虹膜後粘連、玻璃體混濁、滲出性視網膜脫離等。環形鞏膜炎吸收後往往瘢痕變薄，可演變成鞏膜葡萄腫。
後鞏膜炎炎症消退後，可引起鞏膜和眼球筋膜的永久性粘連、眼外肌麻痺或並發球後視神經炎。值得注意的是一種少見並發症——鞏膜壞死軟化，病變部位呈腐肉樣外觀，壞死組織脫落後，造成局部鞏膜組織缺損，葡萄膜暴露，最終出現鞏膜穿孔。
預防並發症的措施主要包括早期診斷，查找確切病因，應用有效藥物對因治療。本病對治療反應遲鈍，因此治療上應持之以恆，局部結節消失後，仍應維持治療2～3周，以防止復發。