治療先天性白內障的目標是恢復視力，減少盲目的發生。
1.對視力影響不大者，如前極白內障、冠狀白內障和點狀白內障，一般不需治療，宜定期隨診觀察。
2.明顯影響視力者，如全白內障、繞核性白內障應選擇晶狀體切除術、白內障囊外摘除術、超聲乳化白內障吸除術，對於膜性白內障可選擇膜性切開術等。手術愈早，患兒獲得良好視力的機會愈大。對於單、雙眼全白內障或位於視軸中心、混濁程度明顯的白內障，應在出生後及早手術(出生4周後)，最遲不超過6個月。雙眼白內障者在完成一眼手術後，應在較短的時間間隔後完成另一眼手術。對於因風疹病毒引起的先天性白內障不宜過早手術。這是因為在感染後早期，風疹病毒在晶狀體內還存在，手術時可使這些潛伏在晶狀體內的病毒釋放而引起虹膜睫狀體炎，有可能因炎症而引起眼球萎縮。
3.無晶狀體眼需進行屈光矯正和視力訓練，治療弱視，促進融合功能的發育。常用的矯正方法有：(1)眼鏡矯正：簡單易行，容易調整更換。(2)角膜接觸鏡：適用於大多數單眼的無晶狀體患兒，但經常取戴比較麻煩，容易發生角膜上皮損傷和感染。(3)人工晶狀體植入：由於顯微手術技術的發展和人工晶狀體質量的提高，人工晶狀體植入後嚴重並發症已很少，兒童施行人工晶狀體植入術已被接受，尤其是單眼先天性白內障患者。目前認為，一般最早在1.5～2歲時施行人工晶狀體植入手術。