在發病早期和高峰期作分泌物塗片或結膜刮片檢查，確定致病菌，並作藥敏試驗，選擇有效藥物治療。一般病程晚期細菌學檢查陽性率較低。
對分泌物多的患者，可用3%硼酸溶液或生理鹽水沖洗結膜囊，若分泌物不多，可用消毒棉簽蘸上述溶液清潔眼部。
早期冷敷可以減輕本病引起的眼部不適症狀。
局部治療：根據不同的病原菌選用多種抗生素眼藥水滴眼，如10%磺胺酰酰鈉、0.25%氯霉素、0.5%～1.0%紅霉素液或新霉素等，根據病情輕重，每隔2～3小時以至每隔1小時一次；睡前塗抗生素眼膏如0.5%四環素、紅霉素或金霉素眼膏防止眼睑粘著，同時使藥物在結膜囊內保留較長時間。在並發角膜炎時，應按角膜炎處理。
治療要及時、徹底，防止復發