抗生素和磺胺藥對於本病基本無效，皮質類固醇減輕炎症反應。對於腸道病毒目前尚無有效藥物，僅有羟苄苯並咪唑（2-hydroxybenybenzimidazole，簡稱HBB）在組織培養系統中，50微克/毫升能有效地抑制腸道病毒70型柯薩奇A24型，為今後開展防治本病，提供了實驗依據。國內報告有采用冷鹽水洗眼或汞劑滴眼治療取得一定療效者。 羟苄苯並咪唑別名：羟苄唑,羟苄苯並咪唑。外文名：Hydrobenzole,HydroxybenzylBenzimidazole，HBB,α-Hydrozybenzylbenzimidazole。藥理作用：抗微小RNA病毒藥。抑制人類腸道病毒、柯薩奇病毒、脊髓灰質炎病毒和"紅眼病毒"。適應症：主要用於治療急性流行性出血性角結膜炎。用法及用量：滴眼液點眼:1～2滴/次，4～6次/日，或遵醫囑。不良反應：局部有輕微刺激感。
病期休息有利於隔離與康復。目前尚無特殊有效的療法，抗生素、磺胺藥對本病無療效。抗生素滴眼劑僅用為預防細菌感染。4%嗎啉雙胍(biguanine hydrochloride , ABOB)、 0.1% 羟苄唑 (HBB）、0.1% 三氮唑核苷（virazole）滴眼劑等對有些病毒株有抑制作用。基因工程干擾素滴眼劑有廣譜抗病毒作用，可用於重症治療及密切接觸者預防感染。中藥金銀花、野菊花、板藍根、桑葉、薄荷等熱熏敷或提取液滴眼可緩解症狀。