藥物是青光眼治療的主要方法之一。青光眼的主要臨床特征是眼壓升高，以及因眼壓升高造成的視神經和視野損害。因此青光眼的主要治療目的，是通過藥物或手術降低眼壓。降眼壓的藥物可以分為眼局部應用和全身應用兩種，主要通過減少房水生成，和（或）增加房水流出，以降低眼壓。
治療首選局部用藥
β-腎上腺素受體阻滯劑：是目前最常用的降眼壓藥物，主要有0.5％噻嗎心安，0.5%貝它根、1%和2%美開朗，以及0.25%貝特舒滴眼液，每天滴眼兩次。主要產生心血管系統和呼吸系統的不良反應，表現為心率減慢、心律不齊、血壓下降以及誘導或加重慢性阻塞性支氣管肺病和哮喘。
擬膽鹼作用藥物：最常用的是毛果芸香鹼滴眼液，每天4次，晚上塗用同等濃度的眼膏，以避免夜間眼壓升高。主要的不良反應是瞳孔縮小和調節痙攣。
腎上腺素受體激動劑：臨床上常用的是1％左旋腎上腺素，及其前體藥0.1％地匹福林滴眼液，每天滴眼兩次。主要的不良反應是收縮局部血管，藥效過後會發生反射性結膜充血。
局部碳酸酐酶抑制劑：主要有1％布林佐胺（派立明）滴眼液，每天滴眼兩次。主要的不良反應是結膜炎，還有眼局部異物燒灼感和口中味苦感。磺胺類藥品過敏者禁用。
α-腎上腺素受體激動劑：主要有溴莫尼定（0.2％阿法根）滴眼液，每天滴眼兩次。主要不良反應有疲倦乏力、口干和眼部不適感，部分嚴重者有嗜睡感。
前列腺素衍生物：目前臨床應用的有0.005%拉坦前列素（適利達）、0.004%曲伏前列素（蘇為坦）、0.03％貝美前列素（盧美根），每晚一次。不良反應有眼部充血、不適感，長期應用可增加虹膜色素、令睫毛粗長。
全身用藥見效快但不能長期使用
全身用藥，多作為手術前的用藥，或作為局部用藥不能良好控制眼壓時的補充。使用時需注意，劑量不宜過大，使用時間不宜過長。主要藥物有：
碳酸酐酶抑制劑：以乙酰唑胺(醋氮酰胺)為代表，每天口服兩次，對磺胺過敏者禁用。不良反應有唇面部及手指、腳趾麻木感、胃腸道刺激症狀等。如果長期服用，有誘發尿路結石、腎絞痛、代謝性酸中毒、低血鉀和肝功能損害等不良反應，服用時常口服氯化鉀和碳酸氫鈉，以減少不良反應。
高滲脫水劑：常用藥物是20%的甘露醇注射液，快速靜脈滴注，脫水利尿，降低眼壓起效快。過多地應用或長時間應用，可引起全身脫水、電解質紊亂等。
青光眼為慢性疾病，一經診斷需終身治療，以維持有用的視功能，保障生活質量。
大多數患者不會滴眼藥水
滴眼藥水，說起來容易做起來難。很多患者滴眼藥水使用了錯誤的方法，不是把藥水灑在臉頰上就是滴在眼睑上，只有少部分患者能按處方要求把一滴眼藥水准確無誤地滴進眼睛。實際上，用於治療青光眼的眼藥水屬於處方藥，藥量太多或太少不但可能導致治療無效，而且會加重病情。
滴眼藥水的正確方法：
用眼藥前拭淨眼部的分泌物。滴眼時，頭稍後仰，眼睛向頭頂方向看，一手持藥水瓶，距眼睛2厘米，另一手將下眼睑輕輕拉開，形成一個小囊，將藥水滴入下方結膜囊，滴藥後輕閉眼數秒，防止藥液流出眼外。然後閉眼輕輕轉動眼球數次，讓藥液均勻分布在結膜囊，切記不要將藥直接滴在角膜上；一般每眼滴1—2滴。
眼都有炎症時，先滴炎症輕的一側，後滴炎症重的一側，避免交叉感染；
有毒性的藥水，如散瞳藥阿托品、後馬托品；縮瞳藥毒扁豆鹼、毛果芸香鹼等，滴入後要用手指壓迫淚囊處2—3分鐘，以免藥液進入鼻腔或咽部，吸收後發生不良反應或中毒。
建議，青光眼患者最好配一面可以傾斜觀察到自己滴藥動作的鏡子。如果條件允許，還可由家人幫忙配合滴眼藥水。
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