外源性因眼外傷，眼內手術及角膜潰瘍穿孔等細菌直接進入眼內。手術引起的眼內炎，常見革蘭氏陰性菌的綠膿桿菌引起。但外傷由真菌、厭氧菌和多種微生物致病者比術後感染更為常見。一般情況下在術後24～48小時出現炎症，但目前術後常規結膜下注射抗生素和皮質類固醇，故眼內炎可延至術後2～5天出現，若術後24～48小時疼痛加劇的患者，應考慮為毒性較大的微生物感染。真菌性眼內炎出現症狀為手術後或傷後2～3周內。
化膿性眼內炎（endophthalmitis）：多因穿孔性外傷，眼內容脫出或眼內異物存留，微生物沿傷口進入眼內很快擴展為全葡萄膜炎。患者突然眼痛、流淚，視力下降，眼睑腫脹，結膜高度充血水腫，角膜混濁，虹膜充務呈黃色，瞳也縮小，閉渙或膜閉，前房及玻璃體積膿。另外，炎症可向眼球壁外及眼眶內組織擴散而產生全眼球炎。
內源性（或轉移性）感染性眼內炎多以真菌感染為特征，是經血流到達眼部的感染引起。致病菌可來自遠處的感染灶或全身性敗血症。通常起病隱匿，進展遲緩。