晶體脫位除了產生嚴重的屈光不正外，常產生一些嚴重的並發症。
一、葡萄膜炎 葡萄膜炎是晶體脫位常見的並發症，晶體脫位產生的葡萄膜炎(uveitis)有兩種，一種是葡萄膜組織受到晶體的機械性刺激引起，另一種是脫位晶體變成過熟期白內障，產生晶體過敏性葡萄膜炎，兩種葡萄膜炎都是頑固性的炎症，並可導致繼發性青光眼。 二、繼發性青光眼 繼發性青光眼也是最常見的並發症之一，晶體脫入瞳孔區或玻璃體疝嵌頓在瞳孔，可產生瞳孔阻滯性青光眼，反復發生瞳孔阻滯可使虹膜膨隆，產生無晶體眼性惡性青光眼，長期晶體脫位可產生晶體溶解性青光眼，另外，由眼球鈍挫傷引起的晶體脫位可合並虹膜根部後退，房角劈產生繼發性青光眼。
三、視網膜脫離
視網膜脫離是晶體脫位最常見而嚴重的並發症，尤其在合並先天性異常的眼中，如Marfan綜合征，甚至為雙眼性，晶體脫位引起的視網膜脫離的治療較為困難，因為脫位的晶體往往妨礙尋找視網膜裂孔的准確位置及視網膜脫離的范圍，假如先摘除晶體，又會使玻璃體脫失，加重視網膜病變，延誤視網膜脫離復位手術的時間。
四、角膜混濁
近年來注意到晶體脫位可引起角膜混濁，晶體脫位脫入前房後與角膜內皮接觸，導致角膜內皮細胞損傷，可引起角膜水腫混濁。