眼藥是眼科疾病最常用的藥物，現在很多人將眼藥水變成了日常“必備藥品”，眼部用藥講究多多，若使用不當不但會達不到效果，甚至會加重病情。
原則一：先輕後重
“先輕後重”有兩個含義。一是對於兩眼病症輕重不一的患者，為防止自己雙眼的交叉感染，在滴眼藥時，頭應側向病症較重的患眼；二是先滴較輕患眼，再滴另一側，以免被患眼污染的藥液或患眼的分泌物流向另一只眼睛。
滴眼藥水時，應對准眼部，輕按輕擠，必要時候請旁人幫助，以免“藥”流滿面，而造成浪費或交叉感染。
原則二：一多一少
眼藥水滴眼後感覺較為舒服，但因其存留在眼內時間短，需定時多次使用。一般眼藥水，常規使用是分早、中、晚滴用。眼藥膏則在眼內停留時間較長，藥效作用持久，相比眼藥水應減少使用次數，常規是每晚睡覺前用1次。
對於眼表組織的急性感染，如急性細菌性結膜炎、角膜潰瘍、急性虹膜炎患者，應頻繁使用眼藥水。
細菌感染在治療的最初4小時，需每5～10分鐘滴眼1次；單疱病毒和真菌感染最初2～3日內一般每小時1次，以後視病情變化由醫生決定用藥頻度。
原則三：一次一滴
藥水一次只點一滴，藥膏點約半公分長。因為正常人的結膜囊有10微升的正常淚液，最多還能容納20微升的藥液，而眼藥水一滴的量約30微升（25~35微升），多余的藥液在與淚液混合前已大部分溢出眼外。一次點好幾滴只是徒然浪費而已。眼藥膏的使用則是從內眼角塗到外眼角，然後輕輕閉眼，使眼內覆上薄薄一層藥膏即可。
原則四：先水後膏
如果要同時使用眼藥膏和眼藥水，眼藥膏可妨礙眼液與眼球接觸而影響吸收，應先滴眼藥水後隔10分鐘再塗眼膏。