根據醫學者解釋，一般在疲勞過度、用眼過久或睡眠不足之時，眼皮跳的發生率較為頻繁，其它像是強光、藥物產生的刺激，或眼睛被吹進了異物，或常常抽煙喝酒等等，都會刺激眼睛，引起眼皮跳。另外需要注意的是，眼皮跳動也是人體健康的一個預警信號，特別是和大腦神經有關的。
人的眼皮內有兩種肌肉，一種叫眼輪匝肌，形狀像車輪，環繞著眼睛，當它收縮時，眼皮就會閉合，這種眼輪匝肌受面部神經的支配。而另一種眼皮肌肉叫提上睑肌，當它收縮時，眼皮就會睜開，這種肌肉受動眼神經的支配。
在眼皮的這兩種肌肉組織中，眼輪匝肌對保護眼球有很重要的作用，它能通過不斷的閉合對角膜進行潤滑和清洗，並對任何外來刺激作出保護性反應。
生理性的眼皮跳，不少人經歷過，其發作是一過性的、間歇性的，發作時間很短，常常只是幾秒鐘，跳動程度也不嚴重。多半是休息不夠、疲勞或是吃了刺激性的食物和藥物所致。這種眼皮跳，不影響健康，更與禍福無關。它無需醫治，必要時也只需要閉眼休息一會兒，用手輕輕在跳動點加以按摩，或者熱敷一下，稍加注意飲食，就會自動消失。
病理性原因造成的眼皮跳，一般持續時間長，眨眼幅度大，為一種病態表現，多發生於有心腦血管病的老年人。由於腦干的血管硬化扭曲，一旁與之並行的支配眼皮肌肉運動的面神經被血管壓迫，產生持續性的神經異常興奮，引致肌肉不停收縮，眼睛就眨個不停，這是眼睑痙攣，很難自愈。
更嚴重的是，如果病患部位在基底神經節，痙攣的范圍則擴散到嘴巴、舌頭和下巴。此時，病人不但有不停的眨眼動作，還伴隨面肌的抽搐，這就是面肌痙攣。眼睑痙攣和面肌痙攣，是一種局長肌張力障礙性疾病，更難以自愈。