小兒白內障的發病原因是與染色體與遺傳性有關系的。小兒白內障發病原因的外表來看，與女性懷孕有著直接的關系。女性懷孕前3個月內感染風疹、腮腺炎、麻疹、水痘、甲狀腺功能不足或營養不足等有關尤其是家中養寵物的孕婦，最好停止飼養，以免被病毒感染。
兒童白內障帶來的影響？
1、斜視：約有1/2以上的單眼白內障患者以及不足1/2的雙眼白內障患者都會伴有斜視。由於單眼晶體混濁或屈光力的改變，造成視力下降；或雙眼晶體混濁程度不同而導致雙眼視力不平衡，破壞了融合機制，慢慢的就引起斜視。
2、眼球震顫：由於兒童先天性白內障視力會受到嚴重的影響，不可以注視而出現擺動性或是搜尋性眼球震顫，就能夠繼發性眼球震顫，在白內障術後能夠減輕或消失。若術後眼球震顫不能夠消除，就會影響視力的恢復。
3、先天性小眼球：兒童先天性白內障合並先天性小眼球的思者，視力的恢復是不可能理想的，即便是在白內障術後，視力恢復亦有限。先天性小眼球的存在與先天性白內障的類型無關，可能是會在晶體不正常的發育過程中發生晶體混濁時而改變了眼球的大小，多和遺傳有關。除小眼球外，還能夠合並某些眼內組織（如虹膜、脈絡膜）缺損。