對於眼保健操，社會上一直存在著諸多爭議，一些人士從現代醫學的角度提出“眼操無用論”，甚至有害健康，傳播紅眼病。對此，相關專家認為，這套操的確能起到緩解視疲勞的作用，但其定位不是“治療操”，而是“保健操”。
反駁眼保健操無用論 中醫專家觀點認為，中西醫在理念上有所不同，因此不能單純從現代醫學的角度來評判眼操是否有用，在中醫理論中，眼操的作用並不在於治療，而是預防。大量理論和臨床案例都證明穴位按摩對緩解視疲勞、保護視力、延緩近視有很大的幫助。中醫學自漢代起，就有了針對眼疾的防治。自宋代開始，就有運用決明子等籽實類藥物的記載。唐代起，不少文人墨客的文章中都有提到中醫對眼睛保健的效用。 規范地做眼保健操，可以說是對眼睛有益而無害，至於衛生方面，只要在做操前先洗手即可。
杭州小學自創“轉眼保健操”
近日，杭州下沙的啟源小學卻大膽顛覆創新，自這個學期開始就做起了另外一套眼操。這是一套更為衛生安全的新版眼保健操，做操不再是傳統的按壓穴位，而是盯著手指來回轉動眼珠。
這套眼保健操時長4分鐘左右，一共有4節，分別為“遠近點視覺運動”、“左右圓線視覺運動”、“多方向視覺運動”和“明暗交替視覺運動”，每節8個8拍。
據了解，這套眼保健操名為“多維視覺訓練”，2012年由一位多年從事近視矯正的教授黃維克研發出來。多維視覺訓練方法，是因人而異制定個性化方案，通過圖片識別、眼保健操、光線變化、心理輔導等綜合方法，提高眼肌的興奮度，最終增強大腦神經的傳導功能。它曾在杭州部分小學進行過小范圍推廣。
浙醫二院眼科副主任醫師晉秀明醫生說：“近兩年，類似的眼保健操在網上出現較多。對於效果，從科學角度講，無法籠統說有用或沒用。如果能做一個對比，比如一段時間內，一群人做這套眼保健操，一群人不做，才能得出一個科學結論。